ICDの認定は、ICD制度協議会が行っている。ICDの職務は多くの学会に跨るものである為、協議会認定の学会（下記掲示の学会）に所属している者の中からICDの資格が付与される。現在、ICD制度協議会は日本感染症学会に事務局が置かれており、ICD制度の運営、改訂、感染症管理に携わる研究などを行っている。
ICD資格を得るには、下記の表記するICD制度協議会加盟の学会・研究会のいずれかに所属しており、一定の条件を満たし、所属学会から推薦された者（医師歴5年以上または博士号取得後のPh.D.取得者であること）。
日本感染症学会
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日本環境感染学会
日本細菌学会
日本ウイルス学会
日本医真菌学会
日本寄生虫学会
日本化学療法学会
日本外科感染症学会
日本骨・関節感染症研究会
日本小児感染症学会
日本臨床寄生虫学会
日本臨床微生物学会
日本眼感染症学会
日本救急医学会
日本歯科薬物療法学会
日本口腔感染症学会
日本呼吸器学会
日本耳鼻咽喉科感染症研究会
日本集中治療学会
日本性感染症学会
日本産婦人科感染症研究会
5年毎に資格更新をしなくてならない。その間、規定の単位（感染症関連の学会発表、論文、講習会等により取得できる）を取得しなければ資格は無効となる。